循环冷却水中会包含大量细菌和藻类。温度的升高会提供细菌和藻类生存所需要的环境，因而对冷却水进行杀菌去藻处理是必要的，此时杀菌灭藻剂就是很好的选择。　　氧化性杀菌灭藻剂　　氯气　　在水处理过程中，氯气由于其具有高效、广谱、廉价、物源广、使用较方便等优点,受到人们的青睐，是目前用量大的杀菌灭藻剂。但经氯气处理水中易产生三氯甲烷致癌物质，同时其半衰期长，易对环境产生危害，因此各国相继出台法规,日益严格控制余氯的排放量。另外,氯气在高pH(>8.5)的条件下杀菌活性差的缺点也表现出来,因此人们开发出氯的替代物,如ClO2、溴类杀菌灭藻剂等。　　二氧化氯　　二氧化氯的杀生能力较氯强,约为氯的2.5倍，特别适合合成氨厂替代氯进行杀菌灭藻处理。国外于上世纪70年代中期开始将其应用于循环冷却水。但由于其性能不稳定，不宜运输,限制了其广泛应用。针对这种情况人们采用现场发生ClO2和开发稳定性二氧化氯等措施克服了这一难题。　　溴类杀菌灭藻剂　　溴杀菌灭藻剂可以弥补氯杀菌灭藻剂主要缺点，HOBr比HOCl杀菌速度快,且适用pH范围广，尤其适用于碱性范围;溴胺和HOCl杀菌作用相当，因而可用于被NH3污染的系统中，且溴胺比氯胺类化合物容易降解，不易引起二次污染;Br2比Cl2不易挥发，杀菌时用量可以减少;Br2比Cl2对铜及铜合金的腐蚀要小。但Br2比Cl2价格高。　　非氧化性杀菌灭藻剂　　异噻唑啉酮　　其杀菌性能具有广谱性,同时对粘泥具有剥离作用。在低浓度下有效，一般有效浓度在0.5mg/L,就能很好地控制细菌的生长。相溶性好,能与缓蚀剂、阻垢分散剂及大多数阴离子、阳离子和非离子表面活性剂相容。对环境无害,该药剂在水溶液中降解速度快。对pH值适用范围广，一般pH值在5.5～9.5均能适用。同时具有投药间隔时间长,不起泡沫等优点。上世纪80年代中后期我国也有多家单位研制出类似国外的同类产品，并投入生产。在冷却水中的应用日益广阔。　　戊二醛戊二醛　　几乎无毒,适用范围宽,耐较高温度,，是杀硫酸盐还原菌的特效药，其本身可以生物降解。其缺点是与氨、胺类化合物发生反应而失去活性，因此在漏氨严重的化肥厂不宜使用。　　季铵盐　　它具有广谱、高效性能,还对菌藻污泥具有剥离作用。早期的季铵盐以十二烷基二甲基苄基氯化铵(1227)为代表,目前国内广泛使用的洁尔灭和新洁尔灭均属于此类产品。随着技术的进步,该类季铵盐的不足之处也逐步显现出来。主要表现在药剂持续时间短,细菌易对其产生抗药性且使用时泡沫多、不易清除等缺点。为了克服上述缺点,国外又开发出了有代表性的季铵盐新品种,如双烷基季铵盐、双季铵盐、聚季铵盐等。　　目前这类产品在国内已经有一定的生产和应用。　　季膦盐　　它的出现是目前杀菌灭藻剂进展之一。这类化合物与季铵盐有着相似的结构,只是以磷阳离子代替氮阴离子。迄今虽然对它的各种性能参数认识并不全面,但它用于工业水处理及油田水处理确实具有高效、快速、广谱,对环境、鱼类具有低毒，易生物降解和使用方便等优点。　　复配　　是近年来的新趋向近年来人们仍不断寻找新的非氧化性杀菌灭藻剂，广谱高效，对菌、藻均有效,pH影响小,低毒环保、性能/价格比好且易于使用和运输。然而，开发新的非氧化性杀菌灭藻剂耗资巨大,需要时间长。这样,如何通过复配已有的非氧化性杀菌灭藻剂，使之产生增效、互补作用,药剂投加量减少，费用降低。因此,使用复合非氧化性杀菌灭藻剂成为近年来的又一个发展新趋势。　　杀菌灭藻剂使用相对与氯气来说，不需要添加去除余氯的步骤，可以完全解决循环冷却水杀菌去藻的任务。